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代謝組學(xué)結(jié)果分析應(yīng)用

  在靶向檢測(cè)中通過(guò)有國(guó)家認(rèn)可證書(shū)的標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì),樣品上機(jī)與標(biāo)準(zhǔn)品比對(duì),更準(zhǔn)確的定性定量分析。非靶向檢測(cè)沒(méi)有具體的標(biāo)準(zhǔn)品參考,可利用面積歸一化法進(jìn)行半定量。

  代謝物鑒定必須以可靠性為前提,采用國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)、嚴(yán)格的假陽(yáng)性率控制、定性準(zhǔn)確率評(píng)估、對(duì)比國(guó)際頂尖實(shí)驗(yàn)室等方法,提高實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)確度。非靶向代謝通過(guò)對(duì)樣品中所有離子峰的采集,最大程度的反映生命體外對(duì)外界刺激、病理生理變化、以及本身基因突變而產(chǎn)生的體內(nèi)代謝水平的多元?jiǎng)討B(tài)反應(yīng)。目前我們主要用高分辨率的液質(zhì)聯(lián)用設(shè)備檢測(cè)對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。

  在代謝組學(xué)數(shù)據(jù)中最為常見(jiàn)的標(biāo)準(zhǔn)化方法是基于QC(質(zhì)量控制)樣本的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化。簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),就是將所要采集的所有樣本取等量混合起來(lái),組成QC樣本,然后在采集數(shù)據(jù)的時(shí)候,每隔一定數(shù)量的樣品,插入一針QC樣本。因?yàn)镼C樣本都是一樣的,因此可以用QC樣本來(lái)模擬數(shù)據(jù)采集過(guò)程中信號(hào)的變化。得到數(shù)據(jù)之后,對(duì)每一個(gè)峰,都將QC作為訓(xùn)練集,然后建立預(yù)測(cè)模型,預(yù)測(cè)信號(hào)變化,從而對(duì)樣品中的信號(hào)進(jìn)行校正?,F(xiàn)在一般都是基于QC樣品作為數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化的首選方法。

代謝組學(xué)結(jié)果分析應(yīng)用

  與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,最終是要涉及研究每一個(gè)代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。 疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過(guò)程變化, 最終引 起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過(guò)對(duì)某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。

  代謝組學(xué)研究人員已經(jīng)對(duì)此進(jìn)行了研究。新生兒是否缺失酶基因可以在出生時(shí)就檢測(cè)出來(lái)??蓹z測(cè)出包括涉及合成途徑中的基本成分(如氨基酸)的酶。酶缺失的結(jié)果就是相應(yīng)的代謝產(chǎn)物過(guò)少或過(guò)多。苯丙酮尿癥(PKU)是一種常見(jiàn)的嬰兒疾病。這種疾病是由于缺失將苯丙氨酸水解成酪氨酸所必須的苯丙氨酸水解酶基因,導(dǎo)致血液中苯丙氨酸累積造成的。若是不能及時(shí)檢測(cè)出這種天生的代謝缺乏,在嬰兒出生后九個(gè)月內(nèi)就會(huì)引起無(wú)法挽救的大腦損傷。這種疾病通過(guò)簡(jiǎn)單的血樣和尿素化驗(yàn)就可以確診。而血樣和尿素化驗(yàn)以后也將成為代謝指紋研究方法的一部分。像苯丙酮尿癥那樣的疾病,研究人員正試圖從疾病的生物化學(xué)基礎(chǔ)著手,而不是僅僅檢測(cè)生物標(biāo)記物。他們希望通過(guò)代謝組學(xué),可以找到更好的方法去治療這些疾病。

  有專家表示“代謝組學(xué)還只是在初生階段”,如果我們能夠了解代謝產(chǎn)物的 5-10%就很幸運(yùn)了。若是這樣考慮的話,現(xiàn)實(shí)就是,我們對(duì)這些分子的作用仍然一無(wú)所知。但是,相信隨著其方法的不斷完善和優(yōu)化,代謝組學(xué)研究必將成為人類更高效、準(zhǔn)確地診斷疾病的一種有力手段。

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