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靶向和非靶向代謝組學解析

  代謝是生物體內(nèi)所有生化反應的總成,是生命體維持生命的物質(zhì)基礎,也是研究生命活動的重要基礎。代謝組學是研究生命在內(nèi)、外環(huán)境影響下的內(nèi)源代謝活動,包括對代謝產(chǎn)物種類、數(shù)量及其變化規(guī)律的檢測和分析,從而研究集體生命活動發(fā)生和發(fā)展的本質(zhì)。與其他組學相比,代謝組學具有多種優(yōu)勢:

  1. 代謝物的種類、數(shù)量變化易于檢測;

  2、相比于基因組學和蛋白組學,技術手段更為簡單;

  3、與基因組學和的蛋白組學相比,代謝物數(shù)量少,易于檢測、驗證和分析;

  4、代謝水平變化可實時揭示機體生理病理狀態(tài)。

  代謝組學和其他組學的關系:

  代謝組學根據(jù)研究目的的不同,可進一步分為非靶向和靶向代謝組學。非靶向代謝組學是對有機體內(nèi)源性代謝物的全面、系統(tǒng)的分析,是一種無偏向的代謝組學分析,可以發(fā)現(xiàn)新的生物標記物。靶向代謝組學是針對特定一類代謝物的研究分析。二者各有優(yōu)缺點,經(jīng)常結(jié)合使用,用于差異代謝產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)和精準定量,對后續(xù)代謝分子標志物進行深入的研究和分析,這在食品鑒定、疾病研究、動物模型驗證、生物標志物發(fā)現(xiàn)、疾病診斷、藥物研發(fā)、藥物篩選、藥物評估、臨床研究、植物代謝研究、微生物代謝研究中發(fā)揮重要作用。

  非靶向和靶向代謝組學結(jié)合使用:

  非靶向代謝組學是在背景知識有限的基礎上,對整個生命體代謝組進行的系統(tǒng)、全面的鑒定分析,獲取大量代謝物數(shù)據(jù),從中發(fā)現(xiàn)差異代謝物。非靶向代謝組學主要包含以下流程:

  1. 樣本采集與處理

  常見的代謝組學分析樣本包括血漿、尿液、組織、細胞、細胞器等。足夠大的樣本量可以減少樣本個體差異造成的誤差。這些復雜樣本中含有很多其他成分,可能對結(jié)果產(chǎn)生干擾,是影響代謝組學研究是否成功的關鍵因素。常用的樣本處理方法包括蛋白質(zhì)沉淀,差速離心和萃取(固相萃取、液液萃取、超臨界流體萃取、加速溶劑萃取)等。

  2. 實驗分析

  代謝組學常常需要運用多種分析技術手段來滿足不同的實驗需求。常見的代謝組學分析技術包括核磁共振(NMR)、液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS)、氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(GC-MS)、毛細管電泳-質(zhì)譜聯(lián)用(CD-MS)、HILIC--MS等。高分辨質(zhì)譜技術主要有TOF-MS、FTICR-MS、Orbitrap-MS、Sector-MS等。

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