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科學家找到了消除肝癌免疫治療副作用的方法

  作為一種惡性程度非常高的腫瘤,肝癌在全世界范圍內的發(fā)病率和死亡率都位居前列。我國國家癌癥中心最新數據顯示,肝癌導致的死亡排名第二位,是我國人民極大的健康負擔。其中,肝細胞癌(HCC)是肝癌的主要亞型,占據原發(fā)性肝癌的75%-85%。針對HCC治療策略的開發(fā)和改進一直是迫切的臨床需求。

  眾所周知,針對PD-1和CTLA-4的免疫檢查點抑制劑(ICB)已被廣泛用于癌癥治療,對多種晚期癌癥有療效。ICB單藥的臨床數據顯示,納武利尤單抗和帕博利珠單抗分別在晚期HCC患者治療中達到15%和18.3%的客觀緩解率(ORR)。但同時,ICB在約20%的患者中引起了3級或以上的免疫相關不良事件(irAE)。

  聯(lián)合免疫療法雖然提高了HCC患者的ORR,但irAEs發(fā)生率也隨之增加。例如,抗PD-1聯(lián)合抗CTLA-4的ORR為31%,3/4級irAEs的發(fā)生率為37%;抗PD-L1聯(lián)合抗血管內皮生長因子-A(VEGF-A)的ORR為27.3%,3/4級irAEs的發(fā)生率為56.5%。因此,要改善HCC患者的免疫治療結果,就必須先消除ICB的副作用。

  近日,由新加坡國立癌癥中心的David Tai和新加坡國立大學的Valerie Chew領銜的團隊,在Journal of Hepatology期刊發(fā)表重要研究成果 。

  通過深度單細胞免疫分析,他們發(fā)現HCC患者的血液樣本中不同的抗原遞呈細胞(APC)和效應記憶T細胞(TEM)亞型,可作為區(qū)分ICB應答和副作用的生物標志物。而通過控制僅影響ICB副作用產生的免疫通路,他們在小鼠模型中證實,TNFR2抑制可以在保證ICB治療效果的同時消除免疫治療的副作用。

  研究人員首先收集了在新加坡接受抗PD-1治療的HCC患者(以下簡稱SG組)治療前和治療中的血液樣本,通過質譜流式細胞術(CyTOF)和單細胞測序研究了ICB應答和irAEs的發(fā)生機制以及生物標志物。接下來他們進行了多輪驗證,包括收集來自韓國的HCC患者樣本(以下簡稱KR組)作為獨立驗證組,用流式細胞術驗證他們從SG組分析中發(fā)現的生物標志物,對SG組治療前和治療后1周的腫瘤活檢樣本進行批量測序分析,最后使用小鼠HCC模型進行治療驗證。

  研究者們對所有患者(SG+KR)進行了兩種分組。根據ICB治療結果,患者被分為有反應者(Res,即部分緩解[PR]或疾病穩(wěn)定[SD]≥6個月的患者)和無反應者(Non-Res,即6個月內有疾病進展的患者)。6個月的時間點是根據Checkmate040研究判定,其結果顯示接受納武利尤單抗治療的HCC患者中,SD≥6個月的患者占比37%。

  根據是否有過irAEs副作用發(fā)生,患者被分為不良反應組(Tox,即經歷過2級[G2]或以上irAE的患者),和無不良反應組(non-Tox,即經歷過G1或無irAE)。值得注意的是,G2 irAE是考慮干預或中斷ICB的指標。為了找到可以在治療早期預測ICB應答或篩查irAEs高風險患者的生物標志物,研究者們選取了SG組中治療前和治療早期(<6周)的樣本(n=21)。

  通過分析6個Res與六個Non-Res樣本的CyTOF結果,研究者們發(fā)現了三個在Res組中富集的T細胞簇:FoxP3+CD4+T細胞(C33),FoxP3+CTLA4+CD4+調節(jié)性T細胞(Treg)(C3),以及CD8+CD45RO+CCR7-CXCR3+TEM(C76)。此外,他們還發(fā)現了兩個不同的CD11c+髓細胞簇,在Res組富含的HLADRhiCD86+APC簇(C4),和在Non-Res組富含的CD14+HLADRlo/-,疑似髓源性抑制細胞簇(MDSCs)(C37)。

科學家找到了消除肝癌免疫治療副作用的方法

  ICB Res和Non-Res患者的血液中有不同免疫細胞亞型

  接下來,研究者們用流式細胞術對SG和KR組樣本進行了驗證,對ICB有較好反應的Res組患者血液中普遍有更多Treg,APC,和CXCR3+CD8+TEM細胞。此外,多變量分析顯示,這些生物標志物與Res組更好的無進展生存期(PFS)顯著相關。其中CXCR3+CD8+TEM和APC的富集是PFS的獨立預測因子。更重要的是,irAEs分組后的分析顯示,CXCR3+CD8+TEM和APC仍然在SG和KR兩組的Res患者中顯著富集,尤其是在Non-Tox患者中。這些數據表明,外周血CXCR3+CD8+TEM和APC是HCC ICB治療預后的獨立預測因子。

  接下來,研究者們分析了在Tox患者irAEs發(fā)生期間或±兩周內采集的血液樣本,并與在相同時間點采集的Non-Tox患者樣本進行了對比。結果顯示,Tox組的血樣中富含兩個CXCR3+CD38+CD16+CD56+NK細胞簇(C89,C99),而Non-Tox患者血樣則富含三個CD8+T細胞簇,兩種TEM(CD45RO+CCR7-;C66,C76)和粘膜相關不變T(MAIT)細胞(V?7.2+CD161+CD56+CD8+,C96),以及一個髓細胞簇(CD11c+CD14+HLADR+,C27)。流式細胞術的驗證結果也顯示出相同的趨勢。

  有趣的是,前文所提到的在Res組中發(fā)現的CXCR3+CD8+TEM(C76)同樣在Non-Tox組中富集。在不考慮ICB應答的情況下,以上五種免疫亞群(NK,CD8 T,TEM,MAIT,APC)代表了與irAEs相關的生物標志物。

科學家找到了消除肝癌免疫治療副作用的方法

  與ICB副作用相關的外周血免疫細胞

  為了更深入地了解上述免疫亞群,研究者們對10個外周血樣本進行了單細胞測序,其中包括9個治療中期樣本(6個Res和3個Non-Res;5個Tox和4個Non-Tox)和一個治療前樣本(Res/Tox)。利用差異基因表達分析(DEG),他們從59980個單細胞中識別出了29個簇。其中,Treg(CD3D+CD4+FOXP3+CTLA4+IL2RA+)簇,和表達ITGAX(CD11c),HLA-DPA1,THBD(CD141)和CLEC9A的常規(guī)I型樹突狀細胞(cDC1)APC簇,在Res中顯著富集。兩個表達CD14和ITGAX(CD11c)的髓細胞簇,CD14-1和CD14-3,則與Non-Tox相關。研究者們還發(fā)現,這些CD14+簇高表達KLF4和CLEC7A,這是巨噬細胞向免疫抑制性極化的標志。

  為了破譯ICB應答和irAE這兩個不同臨床指標背后的免疫機制,研究者們將目光轉向了與這兩種事件都相關的CD11c+APC。Res患者富集的cDC1簇表達了高水平的HLA相關基因,表明這些細胞具有優(yōu)秀的的抗原呈遞能力。CD11c+APC的基因集富集分析(GSEA)也驗證了這些細胞的功能性,這些細胞的轉錄組富集了包括抗原加工和MHC II類呈遞,T細胞共刺激,干擾素-γ信號傳導等重要的免疫啟動相關基因集。與Non-Tox相關的其他兩個髓細胞簇(CD14-1和CD14-3)的對比顯示,CD14-1比CD14-3表達了更高水平的抗原呈遞HLA相關基因,而CD14-3則表達了更高水平的免疫抑制性細胞受體STAB1(Clever-1)GSEA分析也顯示,相對于CD14-1,與Non-Tox更顯著相關的CD14-3減少了抗原呈遞和炎癥特征的基因集,因此更具備免疫抑制性表型。

  研究者們也對前文中與ICB應答和irAEs相關的重要CD8+T細胞簇(CXCR3+TEM)進行了單細胞測序分析。他們發(fā)現,與所有其他T細胞相比,CXCR3+TEM上調了包括抗原呈遞,HLA(s),炎癥,顆粒酶,和細胞增殖的多個基因,例如MKI67。相反,CCR7,IL7R和LEF1等幼稚T細胞基因在CXCR3+TEM中表達下調,表明這些T細胞有效應記憶表型。GSEA分析也不出所料的呈現出包括炎癥反應,細胞溶解,抗原加工以及通過MHC II類呈遞等基因集在CXCR3+TEM中富集。

  這些結果都顯示,與其他T細胞相比,CXCR3+CD8+TEM呈現出強炎癥和細胞溶解力表型。

  鑒于全身免疫是一個動態(tài)的系統(tǒng),各種細胞串擾都可能影響整個大環(huán)境的免疫功能,研究者們還使用CellPhoneDB[11]對CXCR3+CD8+TEM轉錄組中受體和配體的表達進行了識別,以預測它們與其他免疫細胞的通訊。

  他們發(fā)現,可促進炎癥和腫瘤發(fā)生的三種受體,淋巴毒素α(LTA)受體,腫瘤壞死因子受體超家族(TNFRSF1A,1B),和淋巴毒素β受體(LTBR)[12]均在Res和Tox組的CXCR3+CD8+TEM細胞樣本中富集。也就是說,這些細胞擅長與其他細胞形成促炎相互作用,從而導致ICB應答和irAEs。

  此外,研究者們還觀察到CXCR3+CD8+TEM和髓細胞群之間存在明顯的TNF相互作用。Res患者的TEM和APC之間主要進行的是TNF-TNFRSF1B(TNFR2)信號傳導,Non-Tox患者則是TNF-TNFRSF1A(TNFR1)信號傳導。TNF與TNFR1和TNFR2的相互作用在巨噬細胞活化和炎癥中有著重要角色。

  研究者們用流式細胞術測定了TNF?,TNFR1,和TNFR2的蛋白質表達。他們發(fā)現,Res組的CXCR3+CD8+TEM細胞比Non-Res組表達了更高的TNF?。

  在髓細胞的對比中,Non-Tox組的CD14+單核細胞和CD14-CD11c+HLA-DR+樹突狀細胞(DC)比Tox組增加了TNFR1表達。而對比Res和Non-Res組時,研究者們發(fā)現單核細胞和DC上的TNFR2表達沒有顯著差異。

  也就是說,ICB應答(Res)中TNF信號作用的增加主要是由TNF?上調驅動的,而在沒有irAEs(Non-Tox)的患者中,主要是由于TNFR1表達增加。這表明,我們可以利用不同的TNF信號通路來解耦ICB應答和irAEs的產生,在保留治療效果的同時抑制副作用的發(fā)生。

  為了驗證這個假設,研究者們用小鼠模型進行了抗PD-1和/或抗TNFR1或抗TNFR2的治療試驗。

  經過四輪治療,腫瘤結節(jié)在所有聯(lián)合治療組的小鼠中都顯著減少,而接受抗PD-1+抗TNFR2聯(lián)合治療的小鼠腫瘤負荷為零。

  研究者們還觀察到,抗PD-1+抗TNFR1治療組小鼠的肝臟/體重比顯著增高,而小鼠沒有體重或腫瘤負荷上的明顯變化,這側面說明了這組小鼠表現出了肝臟肥大和炎性副作用。這項結果也證實了研究者們之前在Non-Tox患者中觀察到的TNFR1增加有防止irAEs的保護作用。令人驚喜的是,抗PD-1+抗TNFR2治療組的小鼠副作用水平和對照組一致,并成功清除了腫瘤,這些結果給研究者們的假設提供了有力的支持。

  研究者們認為,TNFR2抑制之所以能在保護ICB作用的情況下降低副作用炎性反應,是因為TNFR2優(yōu)先表達于高免疫抑制型Treg細胞上。為了驗證這個假設,研究者們從患者外周血,非腫瘤肝臟,和HCC樣本中分選了Treg和腫瘤浸潤淋巴細胞(TIL)進行對比。他們發(fā)現,與TIL中的其他細胞相比,Treg的TNFRSF1B(TNFR2)表達顯著高于TNFRSF1A(TNFR1)。與來自外周血的或非腫瘤肝臟組織的Treg相比,TIL-Treg的TNFRSF1B表達也顯著增高。這些發(fā)現證明,TNFR2特異表達于HCC TIL中的Treg細胞,抑制后可以增強抗腫瘤反應,并不會增強全身副作用。

  此外,研究者們還在所有抗PD-1治療組(單藥或聯(lián)合治療)的小鼠腫瘤中觀察到了CXCR3+CD8+T細胞和CD11c+MHCII+XCR1+cDC1細胞數量的增加。前文提到,這些免疫亞型是HCC患者外周血中與ICB應答相關的生物標志物,相似的免疫亞型或是小鼠腫瘤浸潤中起到關鍵抗癌作用的細胞。

科學家找到了消除肝癌免疫治療副作用的方法

  小鼠腫瘤浸潤免疫細胞

  總的來說,這項研究成果揭示了HCC患者外周血TEM和APC與ICB治療應答和irAEs都有重要關系,免疫應答和irAEs反應是由TEM和APC之間不同的TNF信號通路所促成的。因此,通過阻斷造成irAEs的TNFR2信號傳導可實現ICB副作用的消除,這對未來HCC患者的ICB療效早期檢測和聯(lián)合免疫療法的改進都有重要的意義。

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